如何利用perl进行序列比对时给予一定的错误率？[求助]

canoa

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1^# canoa 发表于 2007-05-22 10:17

如何利用perl进行序列比对时给予一定的错误率？[求助]

如何利用perl进行序列比对时给予一定的错误率？[求助]
我使用perl用于生物信息学，由于序列完全相同的可能性很小，所以我必须允许有一定程度的错误率，譬如20%。之前用正则表达式很容易实现完全的比对，现在发现有了错误率设定以后就困难多了。我的设想是每次比对时，进行字符操作，并另外设置一个变量记录不同字符的个数，最后得出一个误差概率。可是在实现的时候有点问题，哪位高手能赐教于我，不胜感激！

cnhacktnt

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2^# cnhacktnt 发表于 2007-05-23 08:55

String::Similarity--Te.
String::Similarity
Text::Similarity
String::Approx
请在 search.cpan.org 看看这几个模块:-)

canoa

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3^# canoa 发表于 2007-05-28 14:22

谢谢.