求助:怎么在windows下安装bioperl

chaosapollo

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1^# chaosapollo 发表于 2007-03-24 21:19

求助:怎么在windows下安装bioperl

求助:怎么在windows下安装bioperl
小弟我刚开始学习bioperl，原来在windows下装了一个ActivePerl-5.8.8.819，今天想把bioperl－1.5.2里最基本的模块装上试用一下,我想最开始应该先转core吧，可每次运行makefile,最后都会显示：'nmake'不是内部或外部命令，也不是可运行的程序或批处理文件……couldn't install Module::Build,giving up.　不知哪位高手能教教小弟，应该怎么解决这一问题[CCB]21[/CCB]

scau_2005

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2^# scau_2005 发表于 2007-05-21 23:27

1) Download nmake --2).
1) Download nmake
2) Double-click to run it, which extracts 3 files. Move both NMAKE.EXE and the NMAKE.ERR files to a place in your PATH; if set up properly, you can move these to your Perl bin directory, normally C:\Perl\bin

这个连接可能对给有所帮助：http://www.bioperl.org/wiki/Installing_Bioperl_on_Windows

greatsun

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3^# greatsun 发表于 2007-06-27 11:59

谢谢！！.

klaus

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4^# klaus 发表于 2007-08-04 19:27

windows下用PPM装比较方便.
windows下用PPM装比较方便。

用CPAN以及Module::Build是linux上的安装方法，装不上的。

biomichael

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5^# biomichael 发表于 2007-08-30 21:26

有代理的要先设代理，然后.
有代理的要先设代理，然后打开命令窗口，键入ppm，然后输入install bioperl就可以了

zhbn999

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6^# zhbn999 发表于 2007-09-08 17:42

ppm是方便，但目前只能安?
ppm是方便，但目前只能安装bioperl 1.2.3，去年还能安装1.4的，可现在不行了，不知为什么。
我是通过CPAN安装了bioperl1.5，用CPAN以及Module::Build的安装方法不只是linux下才用，windows下也可以，而且一般高版本及测试版的模块ppm是不能安装的，还只能用这一方法，具体步骤请参考：
http://www.bioperl.org/wiki/Installing_Bioperl_on_Windows 上的Installation using CPAN or manual installation部分，除按上面要求完成CPAN以及Module::Build等所有模块的安装外，还要案卷VC++6.0，否则会有不能编译的错误。这样的安装十分的麻烦，只要错一步不完成。建议初学者还是用PPM安装个1.2.3版本的就行了。

biomichael

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7^# biomichael 发表于 2007-09-17 16:02

ppm也可以安装1.5以上的，.
ppm也可以安装1.5以上的，我的就是用ppm安装的。建议看一下http://www.bioperl.org/wiki/Installing_Bioperl_on_Windows

pujvzi

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8^# pujvzi 发表于 2008-11-15 11:43

最简单的方法
你已经安装了Perl了。在perl的文件里有个library（大概是这样拼的，我记不清了，就是库文件）。
下载Bioperl的压缩包，无论是linux还是windows都可以。解压，看到里面有个Bio（似乎是这个，我有记不清了）文件夹，里面装的是Bioperl所用的模块啦什么的。把这个Bio文件夹拷贝到Perl的library文件夹里。原则上说，你的Bioperl已经安装上了。

稍有不同的是，没有针对Bioperl的help。不过我从来不看这个，网站里有说明嘛，何必非要安装到自己电脑上呢。

卸载时，把Bio文件夹删除就是了。

我从来没用过在线安装，^_^