怎样找到～～前后匹配的～～～～？

wubingran

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1^# wubingran 发表于 2008-09-09 17:05

怎样找到～～前后匹配的～～～～？

$a="AAAACCCCTTTAGCCCGGgG";

while ($a=~/CCC/g) {

print "$& and $+[0]\n";
}

这个程序运行后：
CCC and 7
CCC and 16

其实大家可以看到～～～在8的位置上也有一个CCC，但是因为7的位置已经匹配过，就造成这部分～～～无法匹配
请问各位大侠怎样来解决问题～～～

使运行出来的结果为：
CCC and 7
CCC and 8
CCC and 16

wubingran

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2^# wubingran 发表于 2008-09-09 18:46

求助呀～～～～～～～～

ly5066113

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3^# ly5066113 发表于 2008-09-10 09:22

QUOTE:

原帖由 wubingran 于 2008-9-9 17:05 发表
$a="AAAACCCCTTTAGCCCGGgG";

while ($a=~/CCC/g) {

print "$& and $+[0]\n";
}

这个程序运行后：
CCC and 7
CCC and 16

其实大家可以看到～～～在8的位置上也有一个CCC，但是因为7的位置已经匹 ...

while ( $a =~ /C(?=CC)/g ) {
print "$&CC and " . ($+[0]+2) . "\n";
}

redspider

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4^# redspider 发表于 2008-09-10 10:40

这个昨天似乎在QQ群上告诉你了，如果要用正则的话可以用前瞻
我觉得还是不用正则比较好。

wubingran

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5^# wubingran 发表于 2008-09-10 12:14

QUOTE:

原帖由 redspider 于 2008-9-10 10:40 发表
这个昨天似乎在QQ群上告诉你了，如果要用正则的话可以用前瞻
我觉得还是不用正则比较好。

那个方法的确可以～～～～不过～～～这样
一是不太好找位点（我要找的是转录起始位点上游，这个已经编好），如果改用substr,得重新编～～～～
二是这样不断的赋值，不断的小字段的搜索～需要很多时间～～～～我要找的是很多序列文件组成的很大～～～不太现实～～～·

wubingran

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6^# wubingran 发表于 2008-09-10 12:17

QUOTE:

原帖由 ly5066113 于 2008-9-10 09:22 发表

while ( $a =~ /C(?=CC)/g ) {
print "$&CC and " . ($+[0]+2) . "\n";
}

首先表示感谢～～～～～

能解释一下：
$a =~ /C(?=CC)/g

以及$&CC 什么意思不？

ly5066113

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7^# ly5066113 发表于 2008-09-10 12:31

QUOTE:

原帖由 wubingran 于 2008-9-10 12:17 发表

首先表示感谢～～～～～

能解释一下：
$a =~ /C(?=CC)/g

以及$&CC 什么意思不？

?= 向前断言，匹配。

大骆驼第五章模式匹配好象没有做详细的讲解。
还是看 perldoc perlre 吧。虽然是英文的，但我感觉看起来还不是很累（俺英文很差的）。

wubingran

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8^# wubingran 发表于 2008-09-10 13:14

xiexie~~~~~~

forlorngenius

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9^# forlorngenius 发表于 2008-09-10 13:23

这种东西用向前断言

redspider

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10^# redspider 发表于 2008-09-10 19:08

QUOTE:

原帖由 wubingran 于 2008-9-10 12:14 发表

那个方法的确可以～～～～不过～～～这样
一是不太好找位点（我要找的是转录起始位点上游，这个已经编好），如果改用substr,得重新编～～～～
二是这样不断的赋值，不断的小字段的搜索～需要很多时间～～ ...

我没有说用 substr 了，那样效率很低的。
我是说，如果用正则的话可以用前瞻，就是楼上所说的前向断言。
如果是我就不用正则，直接一个个比较就 OK 了